自动注释解决的是初始定位

高通量毛细管电泳一次会产生多条轨迹和大量峰。自动算法能利用参考通道、预期序列和相邻轨迹，把条带初步映射到核苷酸位置，大幅减少从空白界面逐峰标记的工作。

这种速度来自模型对常见峰形和相对位置的假设。实验条件偏离假设时，算法仍可能给出完整注释，但完整不等于正确。

基线漂移会改变峰高判断

缓慢抬升的背景会让同一高度的峰呈现不同净信号。若预处理没有正确估计局部基线，后续定量可能把背景变化当成反应性差异。

人工复核时要同时看峰顶和峰两侧，不只看软件给出的单个数值。连续多个位置一起偏高，通常比孤立高峰更像基线问题。

现场提示把本节涉及的设备、文件或实验条件写进当前任务记录；只有能够返回原始来源，后续判断才不会依赖记忆。

肩峰与重叠峰容易错位

两个相近片段可能形成未完全分离的峰，表现为主峰旁的肩部或宽峰。算法若只寻找局部最大值，可能漏掉较弱成分，或把一个宽峰拆成错误的多个位置。

这时应结合相邻通道、序列梯和同批次重复判断。单独拖动一个标记，可能把后续所有位置一起推偏。

参考通道也会出问题

参考通道用于校准迁移位置，但染料强度、饱和和通道串扰会改变其形状。参考峰异常时，样本通道看似整齐的对齐结果也可能建立在错误基准上。

复核者应先确认参考通道覆盖范围，再处理样本峰。不能为了让样本图好看而忽略参考信号缺口。

局部压缩需要看上下文

片段迁移速度在某些区域过于接近，会让多个峰挤在短距离内。自动算法可能在低密度区域表现稳定，却在压缩区连续错配。

把压缩区前后几个可靠峰作为锚点，再逐步检查中间位置，比从最模糊的峰开始修正更稳妥。

修改必须留下理由

人工修正不是把标记拖到视觉上顺眼的位置。应记录修改前后位置、依据的参考通道、相关重复和无法排除的不确定性。

多人共同复核时，理由比操作人姓名更重要。下一位研究者只有看到判断依据，才能决定接受、恢复或重新分析。

定量前设置停机条件

如果参考通道缺失、峰形严重饱和或关键区域无法对齐，应暂停进入定量，而不是用人工修正填满所有位置。无法可靠注释本身就是结果质量信息。

清楚标记不可用区间，可以避免下游统计把缺失当成零值，也能指导是否需要重新实验。

信号复核记录字段

下面的字段不是为了增加表格数量，而是帮助读者把当前判断返回到设备、文件或实验现场。实际项目可按任务删减，但不能用空白默认值替代未知条件。

字段为什么需要记录实际动作
原始轨迹原始轨迹必须在任务开始时写明，不能等结果异常后再凭文件名推测。它用于判断自动标记是否仍贴合原始信号。写入任务清单，并连接到原始来源。
局部基线检查局部基线时，应同时查看它与前一环节的对应关系；单独存在的局部基线记录无法区分峰形异常、参考异常与对齐问题。与代表性样本做一次人工对照。
峰顶位置峰顶位置发生变化时保留旧值、新值和改变原因，这样才能为进入定量或暂停分析留下明确依据，也不会覆盖早期记录。在导出结果前完成第二人复核。
峰宽若峰宽缺失，先标记当前判断的不确定范围，不用默认值把空缺隐藏。这个动作能够判断自动标记是否仍贴合原始信号。无法确认时暂停该区间进入后续计算。
肩峰肩峰必须在任务开始时写明，不能等结果异常后再凭文件名推测。它用于区分峰形异常、参考异常与对齐问题。写入任务清单，并连接到原始来源。
重叠峰检查重叠峰时，应同时查看它与前一环节的对应关系；单独存在的重叠峰记录无法为进入定量或暂停分析留下明确依据。与代表性样本做一次人工对照。
饱和区域饱和区域发生变化时保留旧值、新值和改变原因，这样才能判断自动标记是否仍贴合原始信号，也不会覆盖早期记录。在导出结果前完成第二人复核。
低信号区域若低信号区域缺失，先标记当前判断的不确定范围，不用默认值把空缺隐藏。这个动作能够区分峰形异常、参考异常与对齐问题。无法确认时暂停该区间进入后续计算。
参考通道参考通道必须在任务开始时写明，不能等结果异常后再凭文件名推测。它用于为进入定量或暂停分析留下明确依据。写入任务清单，并连接到原始来源。
尺寸标准检查尺寸标准时，应同时查看它与前一环节的对应关系；单独存在的尺寸标准记录无法判断自动标记是否仍贴合原始信号。与代表性样本做一次人工对照。
染料串扰染料串扰发生变化时保留旧值、新值和改变原因，这样才能区分峰形异常、参考异常与对齐问题，也不会覆盖早期记录。在导出结果前完成第二人复核。
迁移速度若迁移速度缺失，先标记当前判断的不确定范围，不用默认值把空缺隐藏。这个动作能够为进入定量或暂停分析留下明确依据。无法确认时暂停该区间进入后续计算。
局部压缩局部压缩必须在任务开始时写明，不能等结果异常后再凭文件名推测。它用于判断自动标记是否仍贴合原始信号。写入任务清单，并连接到原始来源。
对齐锚点检查对齐锚点时，应同时查看它与前一环节的对应关系；单独存在的对齐锚点记录无法区分峰形异常、参考异常与对齐问题。与代表性样本做一次人工对照。
序列梯序列梯发生变化时保留旧值、新值和改变原因，这样才能为进入定量或暂停分析留下明确依据，也不会覆盖早期记录。在导出结果前完成第二人复核。
缺失峰若缺失峰缺失，先标记当前判断的不确定范围，不用默认值把空缺隐藏。这个动作能够判断自动标记是否仍贴合原始信号。无法确认时暂停该区间进入后续计算。
异常高峰异常高峰必须在任务开始时写明，不能等结果异常后再凭文件名推测。它用于区分峰形异常、参考异常与对齐问题。写入任务清单，并连接到原始来源。
重复样本检查重复样本时，应同时查看它与前一环节的对应关系；单独存在的重复样本记录无法为进入定量或暂停分析留下明确依据。与代表性样本做一次人工对照。
批次差异批次差异发生变化时保留旧值、新值和改变原因，这样才能判断自动标记是否仍贴合原始信号，也不会覆盖早期记录。在导出结果前完成第二人复核。
自动标记若自动标记缺失，先标记当前判断的不确定范围，不用默认值把空缺隐藏。这个动作能够区分峰形异常、参考异常与对齐问题。无法确认时暂停该区间进入后续计算。
人工移动人工移动必须在任务开始时写明，不能等结果异常后再凭文件名推测。它用于为进入定量或暂停分析留下明确依据。写入任务清单，并连接到原始来源。
修改理由检查修改理由时，应同时查看它与前一环节的对应关系；单独存在的修改理由记录无法判断自动标记是否仍贴合原始信号。与代表性样本做一次人工对照。
不可用区间不可用区间发生变化时保留旧值、新值和改变原因，这样才能区分峰形异常、参考异常与对齐问题，也不会覆盖早期记录。在导出结果前完成第二人复核。
定量门槛若定量门槛缺失，先标记当前判断的不确定范围，不用默认值把空缺隐藏。这个动作能够为进入定量或暂停分析留下明确依据。无法确认时暂停该区间进入后续计算。
导出版本导出版本必须在任务开始时写明，不能等结果异常后再凭文件名推测。它用于判断自动标记是否仍贴合原始信号。写入任务清单，并连接到原始来源。
复核人员检查复核人员时，应同时查看它与前一环节的对应关系；单独存在的复核人员记录无法区分峰形异常、参考异常与对齐问题。与代表性样本做一次人工对照。

需要查看完整分析链时，可进入信号实验室；涉及文件来源与环境，则继续阅读数据链指南。

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