预处理不能抹掉实验异常
去噪和基线扣除改善可读性，但过强处理也会消除弱峰。保留原始轨迹与处理版本，才能判断变化来自实验还是算法。
对齐建立相对坐标
参考峰帮助不同毛细管进入相近位置。局部迁移差异过大时，应标记不可用区域，而不是为了重合继续拉伸。
自动注释之后的人工工作
人工复核重点包括肩峰、重叠峰、通道串扰、饱和和局部压缩。修改必须记录依据，避免最终结果与原始信号断开。
RNA结构结果的条件
DMS、CMCT和SHAPE试剂提供不同化学视角；逆转录、参考梯和序列版本共同决定峰位含义。结构模型是这些条件下的解释，不是峰图自动给出的事实。